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科學家的有機生命法則 Zoonomia Project

輸鳥不輸陣,說完鳥基因體,哺乳基因體也不干示弱。2006年開始,29 Mammal Project 當中,科學家就分析了,包括人類在內的29種哺乳動物基因體(約涵蓋49%的哺乳動物科)。2011年,這個計畫的發表結果,發現了人類基因體至少有 5.5% 還在不停進行負向澤汰(purifying selection),4.2% 則進入了演化約束(evolutionary constraint)。  上週在Nature發表的 Zoonomia Project ,原名 200 Mammal Project,打算要研究更多哺乳動物。後來改用傳說中,達爾文發展演化概念的源頭,達爾文阿公(Erasmus Darwin)關於人體病理,解剖和心理方面的著作,Zoonomia; or the Laws of Organic Life,為計畫取名。(可是達爾文本人並不承認有被阿公影響到阿....)  Zoonomia Project 建立了131種哺乳類基因體資料,目標解碼每一個真獸下綱(Eutheria)中的144個科,每科至少一種動物,其中包括許多瀕危動物。加上先前已經建立的動物基因體資料,一共分析了240種哺乳類動物,涵蓋了80%的哺乳動物科,近1億1千萬年的演化過程。(相較於萬鳥基因體計畫,B10K,涵蓋92%的鳥科,共363種鳥類,稍稍遜色了一點)。  Zoonomia Project 為演化分析提供了寶貴的資源,科學家們發現,越是瀕危的動物,基因多樣性(genetic diversity)就越低。另外,科學家們也利用Zoonomia 資料庫來尋找動物們適應不同環境的基因機制,比如說比較人類基因,和身上穿著整套防水毛皮的水獺,還有一些會進入冬眠的老鼠們的基因,科學家們就可以多了解一點,關於人類代謝疾病的機制。科學家們比對人類和其他哺乳類動物的基因體,可以找到許多導致人類遺傳疾病的基因變異區域。  今年稍早,已經有科學家利用 zoonomia 來分析新冠病毒(SARS-CoV-2)可能影響的物種。新冠病毒的主要細胞受體(cellular receptor)是ACE2蛋白(angiotensin converting enzyme-2),而擁有ACE2蛋白的脊椎動物包括鳥,魚,兩棲,爬蟲和哺乳類,共410種。人類的ACE2上有25個胺基酸,對於新冠病毒的感染特別重要。依其他動物的ACE2上,這25個胺基酸與人類的相似度,科學家可以推估,這些動物受新冠病毒感染的危險性高低。科學家一共找到103種動物有可能感染新冠病毒,其中40%是瀕危動物....(天阿....希望不會有動物是因為新冠而滅亡的...)。  Zoonomia 哺乳動物基因體資料庫是線上公開資源,歡迎各界引用,分析,運用創意,發揮 zoonomia 最大的價值。  Zoonomia 哺乳動物基因體資料庫: https://zoonomiaproject.org/  ------------------------------------------------------ 【 收聽 🎧 喜劇系科學 Podcast:Sky in the Wall】 Apple Podcast: 👉 https://reurl.cc/k0rn0n Anchor FM: 👉 https://anchor.fm/wallis-liu Youtube: 👉 https://reurl.cc/6l7KGr 【 收看 👀 喜劇系科學 Articles:Sky in the Wall】 Instagram: 👉 https://reurl.cc/m9rxMW Facebook: 👉 https://facebook.com/skyinthewall ------------------------------------------------------  資料來源: http://www.sci-news.com/genetics/131-placental-mammal-genomes-09049.html https://www.pnas.org/content/117/36/22311 https://www.technologynetworks.com/genomics/news/zoonomia-project-reveals-species-at-risk-of-extinction-342749 https://www.nature.com/articles/s41586-020-2876-6#Abs1 https://www.nature.com/articles/nature10530  圖片來源: http://faculty.baruch.cuny.edu/naturalscience/biology/darwin/biography/erasmus_darwin/zoonomia.html https://en.wikipedia.org/wiki/Erasmus_Darwin #科學家的有機生命法則 #達爾文阿公 #輸鳥不輸陣  

zoonomia project 文青風的資料庫網頁(https://zoonomiaproject.org/) 

達爾文阿公(Erasmus Darwin)關於人體病理,解剖和心理方面的著作,Zoonomia; or the Laws of Organic Life,正是哺乳動物基因體資料庫的名字由來 

Zoonomia project 所分析的物種,約涵蓋80%的哺乳動物科 

2011年發表的29 Mammal Project 所分析的物種,約涵蓋49%的哺乳動物科   
分類:科技

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